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Situado en las dependencias del edificio central, junto a la biblioteca y a la zona de administración.
Incluye cerca de 80.000 pliegos de plantas prensadas y desecadas procedentes fundamentalmente de Andalucía. Está especializado en especies de la familia Crucíferas, malas hierbas de cultivo y especies vegetales endémicas de la Península Ibérica y Baleares. Los pliegos de las plantas se encuentran almacenados en 17 armarios compactos distribuidos por familias, géneros y especies.
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