Uno de los principales compromisos del Museo de Etnobotánica es la conservación de los conocimientos tradicionales que poseen las diferentes culturas sobre el mundo vegetal como resultado de la transmisión generacional, que en la actualidad corre el riesgo de desaparecer. En unas sociedades cada vez más industrializadas, las aportaciones de los conocimientos tradicionales sobre las plantas pueden ser fundamentales no sólo para favorecer la conservación de la biodiversidad en sí misma, sino también como potencialmente valiosos a la hora de dar soluciones a problemas importantes del mundo actual, especialmente en los aspectos más básicos como la salud o la alimentación. Es por ello que las líneas de investigación del Museo de Etnobotánica se centran precisamente en la recopilación de conocimientos tradicionales.

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