El marco conceptual del museo trata fundamentalmente de exposiciones que tuvieron lugar en los años previos a la inauguración del museo, incluidas en el programa cultural que desarrolló el Jardín Botánico de Córdoba dentro de Etnobotánica 92, y cuyo objetivo primordial fue acercar a la sociedad cordobesa al complejo mundo de las plantas: un mundo imprescindible para la supervivencia del ser humano, que hay que amar y respetar.

Las piezas que formaron parte de dichas exposiciones, pasaron, posteriormente, a ser incluidas en los fondos del museo.
Marcaron el momento en que comenzó a hacerse realidad la complejidad documental y conceptual que supone el Museo de Etnobotánica.